Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PIK3CBP42338 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PIK3CBP42338 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms