Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA1P42261 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA1P42261 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms