Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RFC5P40937 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RFC5P40937 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RFC5P40937 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RFC5P40937 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RFC5P40937 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RFC5P40937 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RFC5P40937 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RFC5P40937 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RFC5P40937 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms