Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP8P40818 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP8P40818 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP8P40818 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP8P40818 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP8P40818 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP8P40818 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP8P40818 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP8P40818 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP8P40818 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP8P40818 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP8P40818 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP8P40818 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP8P40818 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms