Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL4AP40617 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL4AP40617 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms