Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX1P40424 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PBX1P40424 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PBX1P40424 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PBX1P40424 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX1P40424 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX1P40424 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX1P40424 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX1P40424 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PBX1P40424 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX1P40424 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX1P40424 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX1P40424 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX1P40424 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PBX1P40424 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX1P40424 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX1P40424 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX1P40424 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX1P40424 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX1P40424 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PBX1P40424 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PBX1P40424 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PBX1P40424 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX1P40424 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX1P40424 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX1P40424 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX1P40424 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX1P40424 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PBX1P40424 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms