Protein–RNA interactions for Protein: P40306

PSMB10, Proteasome subunit beta type-10, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB10P40306 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMB10P40306 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PSMB10P40306 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms