Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEACAM6P40199 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEACAM6P40199 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms