Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	VAC7	YNL054W	3498 nt		4.66	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	YDL026W	YDL026W	312 nt		4.66	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	PRO3	YER023W	861 nt		4.66	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	TSR1	YDL060W	2367 nt		4.66	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	KTR6	YPL053C	1341 nt		4.66	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	YOL153C	YOL153C	1746 nt		4.66	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	KRE29	YER038C	1395 nt		4.65	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	FUN12	YAL035W	3009 nt		4.65	□□□□□ -1.66
NAB3	P38996	ARG82	YDR173C	1068 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YDR222W	YDR222W	1248 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	MLC1	YGL106W	450 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	SUA5	YGL169W	1281 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	ATP12	YJL180C	978 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	GYP6	YJL044C	1377 nt		4.65	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	ACA1	YER045C	1470 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	TRM1	YDR120C	1713 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	POP6	YGR030C	477 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	NIT3	YLR351C	876 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	REH1	YLR387C	1299 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YOR318C	YOR318C	306 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	RPL21B	YPL079W	483 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	MIC60	YKR016W	1623 nt		4.64	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	PDR12	YPL058C	4536 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	CUE3	YGL110C	1875 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	GET3	YDL100C	1065 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	PCL2	YDL127W	927 nt		4.63	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
NAB3	P38996	ADH4	YGL256W	1149 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	NAG1	YGR031C-A	492 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	DID4	YKL002W	699 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YBL096C	YBL096C	309 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YPR148C	YPR148C	1308 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	KIC1	YHR102W	3243 nt		4.63	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	SDS23	YGL056C	1584 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	CDC14	YFR028C	1656 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YOL019W	YOL019W	1656 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	MHR1	YDR296W	681 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YKE4	YIL023C	1041 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	MED11	YMR112C	396 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	ELA1	YNL230C	1140 nt		4.62	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
NAB3	P38996	GPI2	YPL076W	843 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	ECM8	YBR076W	1065 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YIG1	YPL201C	1386 nt		4.62	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	CLN2	YPL256C	1638 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YDR290W	YDR290W	330 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	DDI2	YFL061W	678 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	ERJ5	YFR041C	888 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	DDI3	YNL335W	678 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YOR379C	YOR379C	339 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	SAM4	YPL273W	978 nt		4.61	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
NAB3	P38996	GRX1	YCL035C	333 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	PHO5	YBR093C	1404 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.61	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	PRP11	YDL043C	801 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	IWR1	YDL115C	1062 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	TFA2	YKR062W	987 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	SPO20	YMR017W	1194 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	RIB5	YBR256C	717 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	IMH1	YLR309C	2736 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	FAS2	YPL231W	5664 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	THI21	YPL258C	1656 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	GPI1	YGR216C	1830 nt		4.6	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	MSH1	YHR120W	2880 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YGR026W	YGR026W	837 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	PDX1	YGR193C	1233 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	SPL2	YHR136C	447 nt		4.59	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
NAB3	P38996	VID28	YIL017C	2766 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	OAF3	YKR064W	2592 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	RRG9	YNL213C	645 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	YOR263C	YOR263C	408 nt		4.59	□□□□□ -1.67
NAB3	P38996	KGD1	YIL125W	3045 nt		4.59	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	IOC2	YLR095C	2439 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	GDH2	YDL215C	3279 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	PRR1	YKL116C	1557 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	SEC59	YMR013C	1560 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	NOB1	YOR056C	1380 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	YOR082C	YOR082C	342 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	YDC1	YPL087W	954 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	snR17a	snR17a	333 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	DIB1	YPR082C	432 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	QCR2	YPR191W	1107 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.58	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	UBX5	YDR330W	1503 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	THP1	YOL072W	1368 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	LHP1	YDL051W	828 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	PDS1	YDR113C	1122 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	MDJ2	YNL328C	441 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	ZPS1	YOL154W	750 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	ETR1	YBR026C	1143 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	AZR1	YGR224W	1842 nt		4.57	□□□□□ -1.68
NAB3	P38996	AEP3	YPL005W	1821 nt		4.57	□□□□□ -1.68

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