Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPARGP37231 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPARGP37231 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPARGP37231 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPARGP37231 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPARGP37231 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPARGP37231 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGP37231 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGP37231 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGP37231 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms