Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTBRP36941 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTBRP36941 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTBRP36941 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBRP36941 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBRP36941 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBRP36941 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBRP36941 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBRP36941 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBRP36941 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBRP36941 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTBRP36941 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms