Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHI3L1P36222 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHI3L1P36222 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms