Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN7P35236 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN7P35236 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms