Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTNNB1P35222 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNNB1P35222 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms