Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA4P35212 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA4P35212 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA4P35212 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJA4P35212 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA4P35212 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJA4P35212 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJA4P35212 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJA4P35212 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJA4P35212 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJA4P35212 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJA4P35212 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJA4P35212 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJA4P35212 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms