Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DSG3P32926 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DSG3P32926 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DSG3P32926 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DSG3P32926 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DSG3P32926 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DSG3P32926 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DSG3P32926 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DSG3P32926 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DSG3P32926 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DSG3P32926 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG3P32926 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG3P32926 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG3P32926 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DSG3P32926 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DSG3P32926 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms