Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HOXA10P31260 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXA10P31260 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA10P31260 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms