Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CMPK1P30085 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms