Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGA1P29973 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNGA1P29973 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNGA1P29973 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms