Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF2E2P29084 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E2P29084 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms