Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
PTPRMP28827 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRMP28827 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PTPRMP28827 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
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