Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLNP26678 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLNP26678 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLNP26678 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLNP26678 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLNP26678 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLNP26678 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms