Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA3P26006 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ITGA3P26006 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms