Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NFKBIAP25963 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NFKBIAP25963 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms