Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LMO1P25800 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LMO1P25800 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LMO1P25800 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMO1P25800 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMO1P25800 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO1P25800 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms