Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCND1P24385 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCND1P24385 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCND1P24385 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCND1P24385 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCND1P24385 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCND1P24385 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCND1P24385 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCND1P24385 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCND1P24385 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCND1P24385 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCND1P24385 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCND1P24385 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCND1P24385 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCND1P24385 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms