Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RFX1P22670 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RFX1P22670 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX1P22670 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX1P22670 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX1P22670 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RFX1P22670 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX1P22670 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX1P22670 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX1P22670 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RFX1P22670 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RFX1P22670 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RFX1P22670 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms