Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCP20941 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCP20941 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCP20941 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCP20941 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCP20941 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCP20941 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCP20941 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCP20941 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDCP20941 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCP20941 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms