Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP4AP20648 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP4AP20648 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP4AP20648 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms