Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDSP20132 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDSP20132 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SDSP20132 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDSP20132 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDSP20132 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDSP20132 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDSP20132 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDSP20132 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDSP20132 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SDSP20132 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDSP20132 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDSP20132 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDSP20132 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDSP20132 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDSP20132 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms