Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRAP18433 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRAP18433 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRAP18433 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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