Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCP1P17987 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCP1P17987 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCP1P17987 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCP1P17987 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCP1P17987 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCP1P17987 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCP1P17987 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCP1P17987 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCP1P17987 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCP1P17987 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCP1P17987 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCP1P17987 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCP1P17987 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCP1P17987 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCP1P17987 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCP1P17987 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCP1P17987 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms