Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP2A2P16615 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP2A2P16615 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms