Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GNB3P16520 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GNB3P16520 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GNB3P16520 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GNB3P16520 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GNB3P16520 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GNB3P16520 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNB3P16520 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms