Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPB42P16452 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPB42P16452 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPB42P16452 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPB42P16452 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPB42P16452 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPB42P16452 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EPB42P16452 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPB42P16452 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPB42P16452 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPB42P16452 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPB42P16452 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPB42P16452 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPB42P16452 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPB42P16452 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms