Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GATA1P15976 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA1P15976 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA1P15976 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA1P15976 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GATA1P15976 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GATA1P15976 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GATA1P15976 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms