Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DSPP15924 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DSPP15924 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSPP15924 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSPP15924 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSPP15924 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSPP15924 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DSPP15924 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DSPP15924 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DSPP15924 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DSPP15924 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSPP15924 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSPP15924 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSPP15924 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DSPP15924 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DSPP15924 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DSPP15924 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DSPP15924 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DSPP15924 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms