Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TCF4P15884 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TCF4P15884 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TCF4P15884 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TCF4P15884 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCF4P15884 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCF4P15884 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms