Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAV1P15498 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VAV1P15498 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAV1P15498 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAV1P15498 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAV1P15498 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAV1P15498 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAV1P15498 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
VAV1P15498 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms