Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXD8P13378 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXD8P13378 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXD8P13378 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms