Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GP1BBP13224 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GP1BBP13224 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms