Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIP12755 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIP12755 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIP12755 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIP12755 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIP12755 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIP12755 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIP12755 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKIP12755 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIP12755 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKIP12755 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKIP12755 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SKIP12755 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms