Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GZMAP12544 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GZMAP12544 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GZMAP12544 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GZMAP12544 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GZMAP12544 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GZMAP12544 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GZMAP12544 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GZMAP12544 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GZMAP12544 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GZMAP12544 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms