Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKBP12277 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKBP12277 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKBP12277 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKBP12277 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKBP12277 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKBP12277 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CKBP12277 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKBP12277 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKBP12277 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKBP12277 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKBP12277 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKBP12277 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKBP12277 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKBP12277 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKBP12277 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CKBP12277 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKBP12277 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKBP12277 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms