Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT3P12035 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT3P12035 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT3P12035 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT3P12035 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT3P12035 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT3P12035 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT3P12035 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT3P12035 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT3P12035 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT3P12035 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT3P12035 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT3P12035 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT3P12035 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT3P12035 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT3P12035 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT3P12035 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT3P12035 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT3P12035 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT3P12035 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT3P12035 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT3P12035 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT3P12035 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT3P12035 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT3P12035 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms