Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ODC1P11926 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ODC1P11926 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ODC1P11926 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ODC1P11926 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ODC1P11926 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ODC1P11926 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ODC1P11926 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ODC1P11926 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ODC1P11926 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ODC1P11926 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms