Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF3P11487 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF3P11487 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FGF3P11487 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGF3P11487 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FGF3P11487 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF3P11487 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF3P11487 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms