Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF1P10914 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF1P10914 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IRF1P10914 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IRF1P10914 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IRF1P10914 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IRF1P10914 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IRF1P10914 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF1P10914 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms