Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COX5BP10606 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COX5BP10606 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX5BP10606 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX5BP10606 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX5BP10606 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COX5BP10606 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COX5BP10606 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COX5BP10606 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COX5BP10606 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
COX5BP10606 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms