Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NR2F1P10589 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NR2F1P10589 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms